Variantes do vírus SARS-COV-2 causadoras da COVID-19 no Brasil

Autores

  • Linconl Agudo Oliveira Benito
  • Rosana da Cruz Lima
  • Ana Maria de Lima Palmeira
  • Margô Gomes de Oliveira Karnikowski
  • Izabel Cristina Rodrigues da Silva

Palavras-chave:

Variantes, COVID-19, Brasil, Epidemiologia

Resumo

Objetivo: Analisar as variantes do vírus SARS-COV-2 causadoras da COVID-19 no Brasil, identificadas até fevereiro de 2021. Método: Estudo exploratório, descritivo, comparativo e quantitativo. Os dados foram adquiridos no Ministério da Saúde (MS). Resultados: Foram identificadas as variantes “VOC B.1.1.7, VOC202012/01 ou 201/501Y.V1” do Reino Unido, a “VOC B.1.351 ou VOC202012/02 ou 20H/501Y.V2” da África do Sul e a “VOC B.1.1.28.1 ou P.1 ou 20J/501Y.V3” do Brasil/Japão. As variantes VOV P.1 e a VOC B.1.1.7 foram as mais preponderantes do Brasil, com  o universo de 334 casos, onde a primeira registrou 89,5% (n=299) e a segunda 10,5% (n=35). A região Nordeste (NE) registrou a maior preponderância das duas variantes contabilizando 32,6% (n=109) e o estado da Paraíba (PB) a maior preponderância da variante  VOV P.1 com 23,1% (n=69). Considerações finais: As mutações do vírus SARS-CoV-2, causador da COVID-19, podem ter causado o surgimento de nova linhagem do vírus em circulação no Brasil.

Referências

Cao X. COVID-19: immunopathology and its implications for therapy. Nat Rev Immunol. 2020; 20:269–270. doi: https://doi.org/10.1038/s41577-020-0308-3.

Peng X, Xu X, Li Y, Cheng L, Zhou X, Ren B. Transmission routes of 2019- nCoV and controls in dental practice. Int J Oral Sci. 2020;12(1):9. doi: https://doi.org/10.1038/s41368-020-0075-9.

Velavan TP, Meyer CG. The COVID-19 epidemic. Trop Med Int Health. 2020;25(3):278-280. doi: 10.1111/tmi.13383.

Perlman S. Another decade, another coronavirus. N Engl J Med. 2020; 382:760- 762. doi: https://doi.org/10.1056/NEJMe2001126.

Zhu N, Zhang D, Wang W, et al. A novel coronavirus from patients with pneumonia in China, 2019. N Engl J Med. 2020. 382: 727-733. doi: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001017.

Brasil. Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Operações de Emergências em Saúde Pública - COE-COVID-19. Plano de Contingência Nacional para Infecção Humana pelo novo Coronavírus COVID-19. Brasília: MS. 2020. 24p.

Estevão A. COVID-19. Acta Radiológica Portuguesa. 2020:32(1):5-6. doi: https://doi.org/10.25748/arp.19800 .

Sociedade Brasileira de Pediatria. Documento Científico. Departamento Científico de Infectologia. Novo coronavírus (COVID-19). 2020.12p.

Brasil. Presidência da República. Secretaria-Geral. Subchefia para Assuntos Jurídicos. Lei nº 13.979, de 6 de fevereiro de 2020. Dispõe sobre as medidas para enfrentamento da emergência de saúde pública de importância internacional decorrente do coronavírus responsável pelo surto de 2019. Disponível em: [http://www.planalto.gov.br/ccivil_03/_ato2019-2022/2020/lei/L13979.htm ]. Acesso em: 14 jun 2020.

Brasil. Presidência da República. Secretaria-Geral. Subchefia para Assuntos Jurídicos. Lei nº 14.019, de 2 de julho de 2020. Altera a Lei nº 13.979, de 6 de fevereiro de 2020, para dispor sobre a obrigatoriedade do uso de máscaras de proteção individual para circulação em espaços públicos e privados acessíveis ao público, em vias públicas e em transportes públicos, sobre a adoção de medidas de assepsia de locais de acesso público, inclusive transportes públicos, e sobre a disponibilização de produtos saneantes aos usuários durante a vigência das medidas para enfrentamento da emergência de saúde pública de importância internacional decorrente da pandemia da Covid-19. Disponível em: [ http://www.planalto.gov.br/ccivil_03/_ato20192022/2020/lei/L14019.htm#art2 ]. Acesso em: 22 mar 2021.

Su S, Wong G, Shi W, et al. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses. Trends Microbiol. 2016;24(6):490‐502. doi: https://doi.org/10.1016/j.tim.2016.03.003.

Ruan Q, Yang K, Wang W, et al. Clinical predictors of mortality due to COVID-19 based on an analysis of data of 150 patients from Wuhan, China. Intensive Care Med. 2020;46:846–848. doi: https://doi.org/10.1007/s00134-020-05991-x .

Zhang W, Jiang X. Measures and suggestions for the prevention and control of the novel Coronavírus in dental institutions. Front Oral Maxillofac Med. 2020;2:4. doi: https://doi.org/10.21037/fomm.2020.02.01 .

American College of Radiology. Recommendations for the use of chest radiography and computed tomography (CT) for suspected COVID-19 infection. 2020. Available in: [ https://www.acr.org/Advocacy-and-Economics/ACR-Position-Statements/Recommendations-for-Chest-Radiography-and-CT-for-Suspected-COVID19-Infection ]. Access in: 14 jun 2020.

Epidemiology Working Group for NCIP Epidemic Response, Chinese Center for Disease Control and Prevention. Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2020;41(2):145‐151. doi: https://doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2020.02.003 .

World Health Organization. COVID-19 Weekly Epidemiological Update. Data as received by WHO from national authorities, as of 14 February 2021, 10 am CET. Available in: [ https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update---16-february-2021 ]. Acess in: 23 mar 2021.

World Health Organization. SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health goals: Interim guidance, 8 January 2021.

Organização Mundial da Saúde. Organização Pan-Americana de Saúde. Atualização epidemiológica: Ocorrência das variantes de SARS-CoV-2 nas Américas. 2021.

- Kubista M, Andrade JM, Bengtsson M, Forootan A, Jonák J, Lind K, et al. The real-time polymerase chain reaction. Molecular Aspects of Medicine. 2006;27(2-3):95–125. doi: https://doi.org/10.1016/j.mam.2005.12.007 .

European Centre for Disease Prevention and Control. COVID-19. Available in: [ https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19 ]. Access in: 23 mar 2021.

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Boletim Epidemiológico Especial. Doença pelo Coronavírus COVID-19. Número 52. Brasília, MS. 2021. 85p.

Brasil. Ministério da Saúde. Gabinete do Ministro. Portaria nº 2.031, de 23 de setembro de 2004. Dispõe sobre a organização do Sistema Nacional de Laboratórios de Saúde Pública. Disponível em: [ http://bvsms.saude.gov.br/bvs/saudelegis/gm/2004/prt2031_23_09_2004.html ]. Acesso em: 23 de março 2021.

Almaguer-Mederos L, Cuello-Almarales D, Almaguer-Gotay D. Rol de los genes ACE2 y TMPRSS2 en la susceptibilidad o gravedad de la COVID-19. Anales de la Academia de Ciencias de Cuba. 2020;10(2): e799. especial COVID-19. Disponible en: [http://www.revistaccuba.sld.cu/index.php/revacc/article/view/799].

Rambaut A, Loman N, Pybus O, et al. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations - SARS-CoV-2 coronavirus/nCoV-2019 Genomic Epidemiology - Virological. Available in: [https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563 ]. Acess in: 7 feb 2021.

American Society for Microbiology. Home. Articles. Lee R. B.1.1.7: What We Know About the Novel SARS-CoV-2 Variant. asm.org. Available in: [ https://asm.org/Articles/2021/January/B-1-1-7-What-We-Know-About-the-Novel-SARS-CoV-2-Va ]. Acess in: 05 feb 2021.

Tegally H, Wilkinson E, Giovanetti M, et al. Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa. Med Rxiv 2020; 10. doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.21.20248640 .

Freitas ARR, Giovanetti M, Alcantara LCJ. Emerging variants of SARS-CoV-2 and its public health implications. Interamerican Journal Medicine and Health. 2021; 4. doi: https://doi.org/10.31005/iajmh.v4i.181.

Buss LF, Prete C, Abrahim CAJ, et al. Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic. Science.2020; 371: Issue: 6526: 288-292. doi: https://doi.org/10.1126/science.abe9728 .

Voloch CM, da Silva Francisco R Jr, de Almeida LGP, Cardoso CC, Brustolini OJ, Gerber AL, Guimarães APC, Mariani D, da Costa RM, Ferreira OC Jr; Covid19-UFRJ Workgroup, LNCC Workgroup, Adriana Cony Cavalcanti, Frauches TS, de Mello CMB, Leitão IC, Galliez RM, Faffe DS, Castiñeiras TMPP, Tanuri A, de Vasconcelos ATR. Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil. J Virol. 2021 Mar 1:JVI.00119-21. doi: https://doi.org/10.1128/JVI.00119-21 .

Fundação Oswaldo Cruz. Rede Genômica Fiocruz. Disponível em: [http://www.genomahcov.fiocruz.br/]. Acesso em: 26 março 2021.

Fundação Oswaldo Cruz. Rede Genômica Fiocruz. Pesquisadores e instituições. Disponível em: [http://www.genomahcov.fiocruz.br/a-rede/]. Acesso em: 27 março 2021.

Fundação Oswaldo Cruz. Rede Genômica Fiocruz. Gráficos demonstrativos. Disponível em: [ http://www.genomahcov.fiocruz.br/principais-linhagens-do-sars-cov-2-encontradas-no-brasil/ ]. Acesso em: 28 março 2021.

Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística. Agência IBGE de notícias. Sala de impressa. Estatísticas sociais. IBGE divulga estimativa da população dos municípios para 2020. Disponível em: [ https://agenciadenoticias.ibge.gov.br/agencia-sala-de-imprensa/2013-agencia-de-noticias/releases/28668-ibge-divulga-estimativa-da-populacao-dos-municipios-para-2020 ].Acesso em: 28 março 2021.

Instituto Brasieiro de Geografia e Estatística. Brasil. Amazonas. Manaus. Disponível em: [ https://cidades.ibge.gov.br/brasil/am/manaus/panorama ]. Acesso em: 27 março 2021.

Naveca F, Nascimento V, Souza V et al. COVID-19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long-term persistence of endemic SARS-CoV-2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P.1, 25 February 2021, PREPRINT (Version 1) available at Research Square. doi: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-275494/v1 .

Paiva MHS, Guedes DRD, Docena C, Bezerra MF, Dezordi FZ, Machado LC, Krokovsky L, Helvecio E, da Silva AF, Vasconcelos LRS, Rezende AM, da Silva SJR, Sales KGdS, de Sá BSLF, da Cruz DL, Cavalcanti CE, Neto AdM, da Silva CTA, Mendes RPG, da Silva MAL, Gräf T, Resende PC, Bello G, Barros MdS, do Nascimento WRC, Arcoverde RML, Bezerra LCA, Brandão-Filho SP, Ayres CFJ, Wallau GL. Multiple Introductions Followed by Ongoing Community Spread of SARS-CoV-2 at One of the Largest Metropolitan Areas of Northeast Brazil. Viruses. 2020; 12(12):1414. doi: https://doi.org/10.3390/v12121414 .

Nascimento VA do, Corado A de LG, Nascimento FO do, Costa ÁKA da, Duarte DCG, Luz SLB, Gonçalves LMF, Jesus MS de, Costa CF da, Delatorre E, Naveca FG. Genomic and phylogenetic characterisation of an imported case of SARS-CoV-2 in Amazonas State, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2020; 115, e200310. doi: https://doi.org/10.1590/0074-02760200310.

Delatorre E, Mir D, Gräf T, Bello G. Tracking the onset date of the community spread of SARS-CoV-2 in western countries. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2020; 115: e200183. doi: https://doi.org/10.1590/0074-02760200183.

Prado T, Fumian TM, Mannarino CF, Resende PC, Motta FC, Eppinghaus ALF, Vale VHC do, Braz RMS, Andrade J da SR de, Maranhão AG, Miagostovich MP. Wastewater-based epidemiology as a useful tool to track SARS-CoV-2 and support public health policies at municipal level in Brazil. Water Research. 2021; 191. doi: https://doi.org/10.1016/j.watres.2021.116810.

Resende PC, Delatorre E, Gräf T, Mir D, Motta FC, Appolinario LR, Paixão ACD da, Mendonça AC da F, Ogrzewalska M, Caetano B, Wallau GL, Docena C, Santos MC dos, de Almeida FJ, Sousa Junior EC, Silva SP da, Fernandes SB, Vianna LA, Souza L da C, Ferro JFG, Nardy VB, Santos CA, Riediger I, Debur M do C, Croda J, Oliveira WK, Abreu A, Bello G, Siqueira MM. Evolutionary Dynamics and Dissemination Pattern of the SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.33 During the Early Pandemic Phase in Brazil. Frontiers in Microbiology. 2021;11:3565. Doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.615280.

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Publicado

2021-04-02

Como Citar

Benito, L. A. O., Lima, R. da C., Palmeira, A. M. de L., Karnikowski, M. G. de O., & Silva, I. C. R. da. (2021). Variantes do vírus SARS-COV-2 causadoras da COVID-19 no Brasil. REVISA, 10(1), 205–219. Recuperado de https://rdcsa.emnuvens.com.br/revista/article/view/498

Edição

v. 10 n. 1 (2021): REVISA

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